Publications & Results

Publications

2023

Lukjanová E, Hanulíková A, Řepková J. Investigating the Origin and Evolution of Polyploid Trifolium medium L. Karyotype by Comparative Cytogenomic Methods. Plants (Basel). 2023 Jan 4;12(2):235. doi: 10.3390/plants12020235. PMID: 36678948; PMCID: PMC9866396.

PDF

2022

Vlk D, Trněný O, Řepková J. Genes Associated with Biological Nitrogen Fixation Efficiency Identified Using RNA Sequencing in Red Clover (Trifolium pratense L.). Life (Basel). 2022 Nov 25;12(12):1975. doi: 10.3390/life12121975. PMID: 36556339; PMCID: PMC9785344.

PDF

2021

Lukjanová E, Řepková J. Chromosome and Genome Diversity in the Genus Trifolium (Fabaceae). Plants (Basel). 2021 Nov 19;10(11):2518. doi: 10.3390/plants10112518. PMID: 34834880; PMCID: PMC8621578.

PDF

Vozárová R, Macková E, Vlk D, Řepková J. Variation in Ribosomal DNA in the Genus Trifolium (Fabaceae). Plants (Basel). 2021 Aug 25;10(9):1771. doi: 10.3390/plants10091771. PMID: 34579303; PMCID: PMC8465422.

PDF

2019

Trněný O., Vlk D., Macková E., Matoušková M., Řepková J., Nedělník J., Hofbauer J., Vejražka K., Jakešová H., Jansa J., Piálek, L., Knotová D. (2019). Allelic Variants for Candidate Nitrogen Fixation Genes Revealed by Sequencing in Red Clover (Trifolium pratense L.). International Journal of Molecular Sciences, 20(21), 5470.

PDF

2018

Dluhošová J., Ištvánek J., Nedělník J., Řepková, J. (2018) Red clover (Trifolium pratense) and zigzag clover (T. medium)–a picture of genomic similarities and differences. Frontiers in Plant Science, 9, 724.

PDF

2017

Vlk D., Řepková,J. (2017) Application of next-generation sequencing in plant breeding. Czech Journal of Genetics and Plant Breeding, 53(3), 89-96.

PDF

Ištvánek J., Dluhošová J., Dluhoš P., Pátková L., Nedělník J., Řepková J. (2017) Gene classification and mining of molecular markers useful in red clover (Trifolium pratense) breeding. Frontiers in Plant Science, 8, 367.

PDF

2016

Dluhošová J., Řepková J., Jakešová H., Nedělník J. (2016) Impact of interspecific hybridization of T. pratense× T. medium and backcrossing on genetic variability of progeny. Czech Journal of Genetics and Plant Breeding, 52(4), 125-131.

PDF

Řepková J., Dluhošová J., Nedělník J., Jakešová H. (2016) Vývoj genově specifických DNA markerů pro skríning rostlin ve šlechtění jetele lučního. Úroda, Praha: Státní zemědělské nakladatelství, roč. 2016, č. 12, s. 181-184. ISSN 0139-6013.

PDF

2015

Jakešová H., Řepková J., Nedělník J., Hampel D., Dluhošová J., Soldánová M., Ošťádalová M. (2015) Selecting plants with increased total polyphenol oxidases in the genus Trifolium. Czech Journal of Genetics and Plant Breeding, 51(4), 155-161.

PDF

Štefková M., Dluhošová J., Ištvánek J., Řepková J. (2015) Studium genů jetele (Trifolium spp.) podílejících se na biosyntéze fytoestrogenů. Úroda, Praha: Státní zemědělské nakladatelství, roč. 2015, č. 12, s. 175-178. ISSN 0139-6013.

PDF

Řepková J., Ištvánek J. (2015) Šlechtění rostlin v éře genomiky. Úroda, Praha: Státní zemědělské nakladatelství, roč. 2015, č. 12, s. 11-18. ISSN 0139-6013.

PDF

2014

Ištvánek, J., Jaroš, M., Křenek, A., Řepková, J. (2014) Genome assembly and annotation for red clover (Trifolium pratense; Fabaceae). American Journal of Botany, 101(2), 327-337.

Stáhnout v PDF

Jakešová H., Hampel D., Řepková J., Nedělník J. (2014) Hodnocení krmivářských charakteristik odrůdy Pramedi – mezidruhového hybrida Trifolium pratense x Trifolium medium. Úroda, Praha: Státní zemědělské nakladatelství, č. 12, s. 183-186. ISSN 0139-6013.

Řepková J., Nedělník J. (2014). Modern methods for genetic improvement of Trifolium pratense. Czech Journal of Genetics and Plant Breeding, 50(2), 92-99.

Stáhnout v PDF

Řepková J., Nedělník J., Krtková V., Schulzová V., Novotná H., Hajšlová J., Jakešová H. (2014). Phytoestrogen content in clover (Trifolium spp.) and in grass stands depending on treatment and storage. In: EGF at 50: The future of European grasslands. Proceedings of the 25th General Meeting of the European Grassland Federation, Aberystwyth, Wales, 7-11 September 2014 (pp. 495-497). IBERS, Aberystwyth University.

PDF

2013

Řepková J. (2013) Genetika rostlin. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita. Elportál. ISBN 978-80-210-6408-9.

PDF

Soldánová M., Ištvánek J., Řepková J., Dreiseitl A. (2013). Newly discovered genes for resistance to powdery mildew in the subtelomeric region of the short arm of barley chromosome 7H. Czech Journal of Genetics and Plant Breeding, 49(3), 95-102.

PDF

2012

Řepková J., Simandlová J., Jakešová H., Nedělník J., Soldánová M., Hajšlová J., Schulzová V. (2012) Vztah rodičovských genomů u mezidruhových hybridů Trifolium pratense x Trifolium medium. Úroda, vědecká příloha časopisu 12, 27–30.

PDF

2011

Jakešová H., Řepková J., Hampel D., Čechová L., Hofbauer J. (2011) Variation of morphological and agronomic traits in hybrids of Trifolium pratense x T. medium and a comparison with the parental species. Czech Journal of Genetics and Plant Breeding 47(1): 28–36.

PDF

Řepková J., Nedělník J., Jakešová H., Hampel D., Hofbauer J. (2011) Mezidruhoví hybridi Trifolium pratense x Trifolium medium jako zdroj nové diverzity. Úroda 12, vědecká příloha časopisu, 21–24.

2010

Řepková J. (2010) Potential of chloroplast genome in plant breeding. Czech Journal of Genetics and Plant Breeding 46(3): 103–113.

PDF

Řepková J., Dreiseitl A. (2010) Candidate markers for powdery mildew resistance genes from wild barley PI284752. Euphytica 175: 283–292.

PDF

Teturová K., Řepková J., Lízal P., Dreiseitl A. (2010) Mapping of powdery mildew resistance genes in a newly determined accession of Hordeum vulgare ssp. spontaneum. Annals of Applied Biology 156: 157–165.

PDF

2009

Řepková J., Dreiseitl A., Lízal P. (2009) A new CAPS marker for selection of a barley powdery mildew resistance gene in the Mla locus. Cereal Research Communications 37(1): 93–99

PDF

Řepková J., Hofbauer J. (2009) Seed pod shattering in the genus Lotus and its overcoming. Czech Journal of Genetics and Plant Breeding 45(2): 39–44.

PDF

Řepková J., Teturová K., Dreiseitl A., Soldánová M. (2009) Characterization and chromosomal location of powdery mildew resistance genes from wild barley PI282605. Journal of Plant Diseases and Protection 116: 257–259.

PDF

2008

Pokorný R., Jakešová H., Poláková M., Moravcová H.,Řepková J. (2008) Rezistence mezidruhových hybridů Trifolium spp. k viru žluté mozaiky fazolu. Úroda 305-308. ISSN 0139-6013.

PDF

2007

Dreiseitl,A., Řepková, J., Lízal, P. (2007) Genetic analysis of thirteen accessions of Hordeum vulgare ssp. spontaneum resistant to powdery mildew. Cereal Research Communications: 35(3): 1449–1458.

PDF

2006

Kocábek T., Řepková J., Dudová M., Hoyerová K., Vrba L. (2006) Isolation and characterization of a novel semi-lethal Arabidopsis thaliana mutant of gene for pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein. Genetica 128: 395–407.

PDF

Řepková J., Dreiseitl A., Lízal P., Kyjovská Z., Teturová K., Psotková R., Jahoor A. (2006) Identification of resistance genes against powdery mildew in four accessions of Hordeum vulgare ssp. spontaneum. Euphytica 151: 23–30.

PDF

Řepková J., Jungmannová B., Jakešová H. (2006) Identification of barriers to interspecific crosses in the genus Trifolium. Euphytica 151: 39–48.

PDF

2005

Řepková J., Hlaváčová S., Lízal P., Kyjovská Z., Relichová J. (2005) Molecular mapping of some Arabidopsis thaliana genes determining leaf shape and chlorophyll defects. Biologia, Bratislava 60(4), 443–449.

PDF

2003

Kyjovská Z., Řepková J., Relichová J. (2003) New embryo lethals in Arabidopsis thaliana: basic genetic and morphological study. Genetica 119(3): 317-325.

PDF

Řepková J., Jungmannová B., Jakešová H. (2003) Interspecific hybridisation prospects in the genus Trifolium. Czech Journal of Genetics and Plant Breeding: 39, Special Issue: 318-320.

PDF

2000

Relichová J., Řepková J. (2000) Are T-DNA mutants amenable to standard recombination analysis? Biologia Plantarum 43(1): 19 – 23.

PDF

Applied results

2020

A set of markers in genes effective for higher nitrogen fixing in red clover

Functional sample is technically realized result connected to the development of the test set of 7 genetic markers in Trifolium pratense L. (red clover) genes conferring effective nitrogen fixation. Markers are based on single nucleotide polymorphisms (SNP) in genes participating in the process of nodulation and nitrogen fixation. The marker set is intended for red clover breeding.

A test set for population microarray preparation for effective genotyping and red clover selection

The technically realized result is connected to the development of the population microarray for chosen marker set genotyping and selection in red clover (Trifolium pratense L.) using targeted probes for the detection of allelic variants of genes associated with higher nitrogen fixation. This probe set is utilizable mainly for testing of the large population (hundreds up to tens of thousands specimens).

2019

Genotypes of plants with higher level of fixation of atmospheric nitrogen

Samples in the form of red clover seeds with a defined level of biological fixation of atmospheric nitrogen, verified by subsequent measurement of selected offspring. These plant seeds will serve as input genetic material for further plant breeding using knowledge about their properties.

2018

Functional sample of a population chip

The SNP chip is designed for the determination of genotypes for the selection of red clover with a higher level of fixation of atmospheric nitrogen. The advantage of the technical solution is mainly in its high capacity with use for the entire population. The usability will be realized mainly in breeding in agriculture.

2016

Test bed of specific markers in set of clover signs for evaluating hybrid character Trifolium pratense x T. medium for breeder’s purposes

In the present invention, there are disclosed 795 novel SNP markers defined based on proper sequencing of the next generation of two parental genotypes T. pratense cultivar Tatra and T. medium, which have been a starting material for obtaining hybrid population. SNP markers are distributed all over the clover entire genome.

2014

Identification of gene specific microsatellite markers in red clover
Cert., accred., approved methodologyMethod and procedure concern set of microsatellite markers in specific genes of Trifolium pratense (red clover) based on our own next generation sequencing. The set includes species specific SSR markers in coding sequences (exons) for desaturases, polyphenol oxidases and nodulins participating in biosynthesis of fatty acids, protein quality and nitrogen fixation, in addition of markers in genes for resistance and yield. Methods include specific oligonucleotides and amplification cycles of targeted SSR markers. The marker set has been intended for red clover breeding.

2013

Variety Pramedi

Variety Pramedi (TPM14855) was bred out by interspecific crosses between tetraploid red clover (Trifolium pratense L.) cv. Tatra (2n=4x=28) and zig-zag clover (Trifolium medium L.) (2n=8x=64). It can be recommended as a forage crop on arable land in pure stands or in mixtures with grasses either for direct cattle feeding or for conservation by silage making. Pramedi is also possible to use as a component of grass clover mixtures for long term meadows.

Applied certified methodology

Řepková J., Ištvánek J., Simandlová J., Nedělník J., Jakešová H.
Detection of gene-specific microsatellite markers of red clover. Applied certified methodology 25/14, 31 p., 2014. ISBN 978-80-88000-00-6
Řepková J., Jungmannová B., Soldánová M., Hofbauer J. Methodology for detecting postzygotic barriers to hybridization in the genus Trifolium and obtaining interspecific hybrids. Applied certified methodology, published by the Forage Research Institute, s.r.o. and Agricultural Research, s.r.o. Troubsko, 2008. ISBN 978-80-86908-08-3

Řepková J., Jungmannová B., Soldánová M., Hofbauer J. Metodika pro zjištění postzygotických bariér křížitelnosti u rodu Trifolium a získání mezidruhových hybridů. Uplatněná certifikovaná metodika, vydal Výzkumný ústáv pícninářský, s.r.o. a Zemědělský výzkum, s.r.o. Troubsko, 2008. ISBN 978-80-86908-08-3

Posters

Trněný O., Vlk D., Macková E., Řepková J., Nedělník J., Jakešová H., Novotný P., Boroň J. Study of variability of genes involved in nitrogen fixation in red cloved (Trifolium pratense L.). In XX. setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2019. ISBN 978-80-210-9420-8

Macková E., Řepková J., Mandáková T. Study of karyotype structure and evolution in the genus Trifolium (Fabaceae). In XX. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2019.

Vlk D., Macková E., Řepková J., Trněný O., Nedělník J., Jakešová H., Novotný P., Boroň J. Identification and targeted sequencing of red clover (Trifolium pratense L.) genes responsible for nodulation process and nitrogen fixation. In XIX. setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2018. ISBN 978-80-210-9069-9.

Macková E., Vlk D., Řepková J., Trněný O., Nedělník J., Jakešová H., Novotný P., Boroň J. Study and validation of candidate red clover (Trifolium pratense L.) genes for leghaemoglobin, a key plant protein involved in the fixation of atmospheric nitrogen. In XIX. setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2018. ISBN 978-80-210-9069-9.

Vlk D., Řepková J., Nedělník J., Jakešová H., Schulzová V., a Hajšlová J. Study of red clover (Trifolium pratense L.) genes specific for phytoalexin synthesis. In XVIII. setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2017. ISBN 978-80-210-8765-1.

Macková E., Vlk D., Řepková J., Trněný O., Nedělník J., Jakešová H., Novotný P., Boroň J. Study of red clover (Trifolium pratense L.) genes regulating nitrogen fixation and nodulation process. In XVIII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2017. ISBN 978-80-210-8765-1.

Řepková J., Nedělník J., Jakešová H., Ištvánek J., Simandlová J., Mandáková T., Hampel D., Čechová L. Interspecific hybrids Trifolium pratense x Trifolium medium as the source of new diversity for variety Pramedi breeding. Serbia. 2015.

Řepková J., Ištvánek J., Nedělník J., Jakešová H., Dluhošová J. Next-generation sequencing and genome characterization of red clover and its wild relative zig-zag clover. In: NIAB Innovation Farm, United Kingdom. International Conference on ENHANCED GENEPOOL UTILIZATION - Capturing wild relative and landrace diversity for crop improvement, Cambridge, United Kingdom, 16-20 June 2014. Book of Abstracts. United Kingdom: Bioversity International, Rome, Italy, 2014. s. 91-92, 2 s. ISBN 978-92-9043-995-0.

Dluhošová J., Řepková J. Srovnávací analýza repetitivních sekvencí Trifolium pratense a Trifolium medium sekvenováním nové generace. In Genetická konference GSGM 2014. 2014.

Dluhošová J., Pátková L., Ištvánek J., Soldánová M., Řepková J. Využití diverzity mikrosatelitních lokusů získaných sekvenováním další generace u jetele. In Michaela Wimerová; Jan Komárek. XVI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. První. Brno: Masarykova univerzita, 2014. s. 58-59. ISBN 978-80-210-7340-1.

Jakešová H., Hampel D., Řepková J., Nedělník J, Thygessen K. Hodnocení krmivářských charakteristik odrůdy Pramedi – mezidruhového hybrida Trifolium pratense x Trifolium medium. 2014.

Řepková J., Nedělník J., Krtková V., Schulzová V., Novotná H., Hajšlová J., Jakešová H. Phytoestrogen content in clover (Trifolium spp.) and in grass stands depening on treatment and storage. In Gomer Press Ltd.. EGF at 50: The Future of European Grasslands. 2014. vyd. Wales: European Grassland Federation, 2014. s. 495-498, 4 s. ISBN 978-0-9926940-1-2.